本校係本縣實施省辦高中縣辦初中及適應地方之需要，於民國51年六月由縣府會同頭屋鄉各界人士等組織苗栗縣立頭屋初級中學籌辦委員會，由徐鄉長阿泉先生等十八人為委員，開始籌辦校舍興建事宜。
五十一年七月上旬成立籌備處，由苗栗縣政府派現任校長徐旭和為籌備主任，暫借頭屋國民學校(頭屋國小)辦公。
初中第一屆
於五十一年度新生招考初一生四班，仍暫借頭屋國民學校(頭屋國小)上課。同年十月底校舍興建竣工，即遷入現址上課，始奠初基。並奉省府令派徐旭和先生為校長。
五十二學年又增加四班，五十三年度又增四班，並計劃增至十八班。今後本校當更求增益以發揮教育功能，斯有賴教育當局賢明指示與地方士紳之合作，則幸甚矣!
國中第一屆
五十七學年起，配合九年國教之實施改名為【苗栗縣立頭屋國民中學】至今。
歷任校長
校長姓名 服務期間
徐 校長 旭和先生 51年創校----68年4月
王 校長 坤源先生 68年4月-----73年9月
徐 校長 旭和先生 73年9月-----80年9月
謝 主任 其文先生(代理) 80年9月-----81年3月
楊 校長 木蘭先生 81年3月-----83年8月
余 校長 文秀先生 83年9月-----90年7月
莊 校長 秀蓮女士 90年8月-----94年8月
林 校長 秋嬋女士 94年8月-----98年7月
李 校長 萬源先生 98年8月----102年7月
蔡 校長 家吉先生 102年8月----110年7月
吳 校長 忠道先生 110年8月----迄今
